1、昂贵的建置投资成本：ERP的建置需要花费的软、硬件及顾问公司收取的顾问费都是庞大的开支，往往只有大型企业才有能力导入。2、安全性问题：为合乎电子商务的需要，整合企业功能部门在单一系统所建构出的坚实安全性，在提供网络模块后，受到强烈的挑战。3、不够充分的信息：系统内部的信息无法与其它企业或部门的系统整合，且也未将企业外部的情报整合其中。4、高潜在成本：有下列高成本的花费(1)、训练成本：企业内部人员的教育训练课程成本。(2)、数据转换成本：数据由旧有系统转置到新ERP系统中的转置成本。二、erp系统明细缺点的各类问题点？
erp系统明细缺点：1. MRP运行环境不足 MRP是ERP系统运行的核心，通过主生产计划导出有关物料的需求量与需求时间，再根据物料的需求提前确定投产或订货时间的计算思路，是整个物控、成本核算、计划作业等的基本。MRP有效运行的环境不够成熟， ERP出现单据误判等问题。 2. 生产制造管理的不足 ERP系统缺少制程管理，当前系统仅处于生产领料的初级阶段。 3. 缺少各种报表，如状况表、明细表，统计表 不能直观的从ERP系统中查看工作进度和明细报表，使管理人员不能发挥ERP效能。 4. 外包管理的不足 不能满足公司外包管理需求，目前只体现在外包领退料功能。 5. 系统运行速度慢 在系统核料时非常明显，严重影响使用者的工作效率 6. ERP产品编码不够灵活 在系统操作中，使用最多的就是产品编码，在设定编码应遵循分类展开，简单，易记等原则。
