筑波科学城与其他科技园区在管理方式和发展模式上存在一些差异。首先，筑波科学城采取了国家统一领导、各部门分工协作的管理体系，由政府统一规划和协调各方面的工作。其次，筑波科学城在发展过程中注重基础设施的投资和统一规划，以确保园区的功能完善和生活便利。此外，筑波科学城注重多学科多行业的优势集成，将高能物理、生命科学、材料科学等领域以及化工、机械、电子等部门进行综合研究开发，以提高科技研究和技术创新的成效。而其他科技园区可能采取不同的管理方式和发展模式，具体情况可能有所不同。
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